基因组所《基因组卵白质组与生物信息学报》最新内容精选
2010年第2期《基因组卵白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics)共揭晓了4篇研究性文章以及3篇应用软件说明。其中，永利集团基因组科学与信息重点实验室的陈开富等发明高等真核生物秀丽线虫(Caenorhabditis elegans)的DNA序列以175个核苷酸为单位形成一定的周期性，并且这一周期性可做为具有优异定位的核小体在DNA上的特殊序列标记。运用HMM算法得知核小体并非随机定位于DNA序列上，而是以差别稳固性团结基因组的差别区域，这一发明使得通过模拟盘算解码核小体在基因组上的定位位置成为可能。统一实验室的何西淼、陶舒等通过对人类CGI库(CpG island library)的剖析发明CGI库中品貌最高的序列均来自于线粒体DNA，这为深入明确线粒体DNA对核内DNA甲基化的调控提供了线索。印度的Prabu和Mandal使用已知的植物miRNA从茶(Camellia sinensis)的序列表达标签(ESTs)中判断了4个可能的miRNA，以及30个与其相对应的靶基因，为人们更周全地相识茶中miRNA的功效提供了数据基础。哥伦比亚Quindío大学的Arenas等对顶复门寄生虫(apicomplexan parasites)的胰卵白酶举行了判断和系统发育学剖析，为新型药物和疫苗的研制提供了资助。
别的，本期还揭晓了三款生物信息学的应用软件说明，包括一款判断sRNA定位的盘算引擎PsRNA，一款用于展望C2H2锌指卵白中与靶DNA特异性团结的识别结构域的工具ZiF-Predict，以及一款用于检测、注释以及剖析同源序列或旁系同源序列的软件BiDiBlast。
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