基因组所小鼠组织新转录本判断研究取得新希望相关文章在《frontiers in genetics》杂志揭晓
克日，永利集团胡松年项目组使用新一代测序数据，运用生物信息学要领，在小鼠的几个组织中发明了几千个新的转录本，该研究效果的完成拓宽了转录组数据剖析的思绪，有利于更周全的熟悉小鼠的转录组组成，并进一步增补了其基因组的注释，相关效果论文在《frontiers in genetics》杂志揭晓。
本研究运用的是通已往除核糖体手艺构建的转录组文库的二代测序数据，该项手艺理论上可以捕获较周全的RNA分子。通过深入剖析，在小鼠的大脑、睾丸和胚胎干细胞中有几千个新的转录本（大部分是非编码RNA）被发明。这些新检测到的转录本与转录起始和延伸的信号亲近相关，在这些转录本上游，科研职员看到了H3K4me3,RNAPII团结位点和CAGE等标记转录起始的特征。并且这些转录本的基因组位置，外显子序列和启动子经由了进化的选择，由此可以看出它们潜在的功效性。这些效果界说了一个小鼠基因组的新的转录本荟萃，这些转录本在小鼠的细胞和组织中有一定的功效。
转录组研究是一种被普遍应用的从整体的条理研究质料中基因表达与调控的研究手段，在探索生命历程以及形形色色的生物学问题如疾病爆发等的研究中施展主要的作用。以前的转录组研究主要着重于对mRNA的研究，随着差别类型RNA分子的发明以及其主要生物学功效的展现，转录组的研究内容也随之拓展。新一代测序手艺以其高通量数据的产出为判断低品貌表达的转录本提供了时机，另一方面，文库构建手艺的生长也使科研职员有时机更高效周全的捕获RNA分子。我们将有时机更周全深入的熟悉转录组，并在此基础上开展研究。
文章链接：http://www.frontiersin.org/non-coding_rna/10.3389/fgene.2011.00093/full
新判断的转录本示意，划分定位于基因Tmem180的内含子区域（上）和基因Sap130相近的基因间区
