Genomics,Proteomics & Bioinformatics 2013年第4期内容简介
2013年第4期Genomics,Proteomics & Bioinformatics（GPB）纸质版期刊已经出书，共揭晓文章7篇，包括1篇综述，4篇研究性文章，1篇应用说明和1篇聚会报告。
多形性胶质母细胞瘤（Glioblastoma multiforme, GBM）是中枢神经系统最常见的原发性肿瘤，化疗药物烷化剂替莫唑胺（alkylating agent temozolomide）常被用来治疗该疾病，但人体对替莫唑胺的自然或获得性免疫会使治疗失败。Pier Jr Morin博士（加拿大）等就GBM的形成、治疗要领、替莫唑胺耐性的分子机制、怎样解决耐药性几方面举行了综述，强调了肿瘤代谢组学在替莫唑胺耐性早期诊断中的作用，为GBM的治疗提供了新的要领，具有主要意义。
烟碱型乙酰胆碱受体（nicotinic acetylcholine receptors, nAChRs）与尼古丁依赖性、情绪异常、神经退行性病变及神经�；ぷ饔糜泄�，但其卵白质组学研究还很少。Marina R. Picciotto博士（美国）等使用转基因小鼠模子对α4β2* nAChRs与其他卵白质的相互作用关系举行了探索，并接纳iTRAQ要领举行了卵白质组学剖析。判断出了208种能与nAChRs免疫共沉淀的卵白，其中17种与α4β2 nAChRs显著相关，这为需找新的药理学靶标提供了依据。
Roman A. Zubarev博士（瑞典）等先容了一种新的卵白质组学剖析要领——卵白质组氨基酸和元素组成因素剖析法（Proteome-wide Amino aCid and Elemental composition, PACE），履历证，该要领简朴、迅速，可普遍使用，获得的数据信息量大，有望成为卵白质组学研究的标准化剖析工具。
在我所刘斯奇博士指导下，杨蕾博士等使用real-time PCR和质谱多反应监测法检测5种差别的肝细胞系中醛酮还原酶（aldo-keto reductases, AKRs）基因和卵白表达情形，研究AKRs在肿瘤爆发中的作用。效果批注，AKR1C卵白的高表达与肝肿瘤爆发亲近相关，HuH7细胞系中AKRs的表达与其它四种细胞系完全差别。该研究首次提供了肝细胞系中AKRs在mRNA和卵白水平表达的所有定量信息，为现在手艺条件下选择临床生物标记物提供了新的思绪。
研究卵白质间相互作用关系对药物设计有主要作用。Premendu P. Mathur博士（印度）等研发了一个可用来剖析卵白质间相互作用机制的综合性数据库——PepBind（Peptide Binding Protein Database），包括3100种卵白质复合物的结构、序列信息及一个可盘算卵白质间相互作用力强弱的盘算工具。该数据库可在http://pepbind.bicpu.edu.in/免费使用。
特异性等位基因表达与相关顺式作用元件突变和等位基因特异性表观修饰模式有很大关系，也可能与植物中的杂种优势有关系。本刊编委Xiangfeng Wang博士（美国）等通过追踪杂交玉米幼苗组织的特异性等位基因表达模式和表观修饰模式，剖析其转录组、组卵白修饰和DNA甲基化的高通量测序数据，综合卡方磨练和泊松漫衍等数学理论，研发了一种新的盘算框架来判断特异性等位基因的表达，为相关领域的科学研究提供了很好的盘算要领。
2013年5月18、19日，在北京召开了“数学、盘算机与生命科学交织研究”青年学者论坛，聚会由永利集团国家数学与交织科学中心主理，共有21位在相关领域取得突出效果的青年学者作学术报告，内容涵盖盘算生物学、盘算基因组学、新一代测序数据剖析与应用、癌症基因组学、表观基因组学、元基因组学、卵白质组学及系统生物学等研究领域。本刊特殊约请到聚会主席王秀杰博士（中科院遗传发育所）和张世华博士（中科院数学与系统科学研究院）为我们撰写了本次聚会的聚会报告，希望能给各人带来启发，对数学、盘算机与生命科学交织研究与应用实践的迅速生长有增进作用。
另外，GPB将在明年2月出书“Ribogenomics”的专刊，由主编于军博士担当Guest editor，接待各人起劲投稿。
以上文章全文可在GPB主页（http://www.elsevier.com/locate/gpb）或ScienceDirect数据库（www.sciencedirect.com/science/journal/16720229）中浏览下载，接待各人阅读、引用。
