北京基因组所开揭晓观关联剖析知识库EWAS Atlas
克日 ，由基因组所开发的表观关联剖析知识库EWAS Atlas正式上线。该项研究效果以“EWAS Atlas: a curated knowledgebase of epigenome-wide association studies”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research在线揭晓。
近年来 ，随着表观组测序手艺特殊是DNA甲基化测序手艺的生长 ，大宗研究最先关注表观组变异与表型 ，行为和疾病的关系。表观关联剖析（EWAS）已经成为剖析表观修饰与重大表型关系的主要手段。大宗EWAS研究爆发了数以百万计的表型和表观修饰关联 ，然而缺乏一个专门的数据库来整合这些名贵的资源。
北京基因组研究所生命与康健大数据中心开发了针对EWAS的人工审编知识库EWAS Atlas。围绕EWAS研究中的主要因素 ，EWAS Atlas建设了EWAS研究的整合与审编标准。差别于已有的表观数据资源库 ，EWAS Atlas是一个完全基于人工审编和文献挖掘的知识库。目今版本的EWAS Atlas主要关注DNA甲基化这一主要的表观修饰 ，EWAS Atlas一共整合了401篇文献中649个研究报道的329,172个高质量的甲基化与表型关联。这些关联一共涉及到305种表型 ，1,830个行列以及390种表型本体。别的 ，EWAS Atlas还配备了功效强盛的表型富集工具 ，用于研究表型与表型、表型与表观变异的关系。未来 ，EWAS Atlas将会整合更多差别类型的表观修饰 ，并将全基因组关联剖析与表观组关联剖析相团结。
EWAS Atlas提供了高效的盘问方法 ，科研职员可以通过基因、探针号、表型等信息盘问相关的EWAS关联信息。别的 ，EWAS Atlas还提供了批量下载、统计等功效资助用户更好的使用数据库。
作为生命与康健大数据中心表观知识库的主要组成部分 ，EWAS Atlas致力于表观关联剖析知识的审编、整合与标准化 ，并最终为研究重大表型的表观机制提供资助。
该研究获得了永利集团战略性先导科技专项、863妄想、永利集团“十三五”信息化专项等基金资助。
论文链接
数据库链接
