北京基因组所（国家生物信息中心）相助研究提醒EB病毒相关淋巴增殖性疾病中具有潜在预后分层价值的遗传特征
EB病毒（Epstein-Barr virus, EBV）是最常见的人类疱疹病毒，其熏染泛起全球性的漫衍。90%以上成年人EBV血清抗体阳性，大大都体现为自限性的无症状熏染。但部分人群无法有用地控制熏染，生长为可能危及生命的EBV相关T/NK细胞淋巴组织增殖性疾�。‥BV-T/NK-LPDs）。成人EBV-T/NK-LPDs是一组包括惰性/急性希望、预后区别极大的高度异质性谱系疾病。爆发免疫太过激活的噬血细胞综合征或转变为淋巴瘤、白血病是患者预后差的要害因素。早期预警危害患者并接纳起劲治疗（如适时移植）将有助于拯救病人生命。但怎样识别高危害EBV-T/NK-LPDs仍是领域难题。
聚焦成人EBV-T/NK-LPDs具有免疫系统失调或转化为肿瘤的奇异特征，永利集团（国家生物信息中心）王前飞团队与华中科技大学同济医学院隶属同济医院周剑峰团队相助，首次在大样本行列中系统地描绘了成人EBV-T/NK-LPDs的先天突变和获得性突变图谱，提出了成人EBV-T/NK-LPDs具有部分（前）肿瘤特征；新发明了病毒识别信号通路RIG-I失调是该病发病的主要分子机制之一；并筛选出一组具有潜在预后分层作用的突变基因荟萃。相关研究效果以“Clinical and Genetic Characterization of EBV-associated T/NK lymphoproliferative diseases”为题，于2022年11月21日在美国过敏、哮喘和免疫学学会官方杂志Journal of Allergy and Clinical Immunology在线揭晓。
本研究纳入了迄今最大的单中心成人发病为主EBV-T/NK-LPDs行列（n=119）。研究团队人工审编并构建了包括372个免疫基因的知识库。接纳基因水平先天突变负荷磨练的遗古板计学要领，判断到8个先天易感基因。整合全外显子组测序和靶向深度测序，发明了19个肿瘤驱动基因体细胞突变。上述突变基因功效涉及到免疫杀伤、病毒识别、表观修饰和转录因子等�？共《臼侗鹜稲IG-I-like相关基因（IFIH1和DDX3X）突变频率最高，且第一次在成人EBV-T/NK-LPDs中被发明。体外细胞系试验和转录表达谱剖析批注，IFIH1和（或）DDX3X突变下调RIG-I通路活性并激活EBV编码原癌基因LMP1等表达，并与EBV载量升高亲近关联。通过临床统计剖析，发明爆发突变的患者预后差于未突变患者，爆发RIG-I-like和表观突变患者预后最差。单中心研究提醒上述遗传突变基因荟萃（总计26个基因）具有潜在的预后分层作用。遗传特征与临床关联性期望能在自力行列中进一步验证。
永利集团（国家生物信息中心）王前飞研究员、华中科技大学同济医学院隶属同济医院周剑峰主任为本文配合通讯作者，同济医院罗辉及基因组所刘丹、刘文兵为本文的配合第一作者。该研究获得了国家重点研发妄想、国家自然科学基金、北京市自然科学基金等项目资助。研究效果揭晓之际，周剑峰主任已因病不幸离世，我们深切思念周主任；衷心谢谢他为EBV相关疾病研究领域做出的优异孝顺以及对本项研究的倾力指导和全力支持。
EB病毒相关淋巴组织增殖性疾�。‥BV-T/NK-LPDs）的临床和遗传变异特征
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