北京基因组所（国家生物信息中心）宣布原核生物泛基因组数据库ProPan
相比于古板的较量基因组学剖析 ，泛基因组学为开展物种基因组动力学、分类及判断、致病性和情形顺应等研究提供了新的视角 。
克日 ，永利集团（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的原核生物泛基因组数据库（ProPan）正式上线 ，旨在提供多物种的基因组动力学特征 ，为物种要害抗性和代谢相关基因判断及其演化纪律研究提供主要的数据资源 。该研究效果以“ProPan: a comprehensive database for profiling prokaryotic pan-genome dynamics”为题在国际学术期刊Nucleic Acid Research 在线揭晓 。
ProPan不但剖析了多个原核生物物种的基因组动力学特征 ，还举行了基因簇核苷酸多样性盘算、COG功效富集剖析、31个要害代谢循环历程及图谱构建、126种物质（包括杀菌剂、抗菌药物和金属）抗性基因展望和基因保存/缺失变异剖析等 。现在 ，ProPan共网络了432个属的1504个物种（23个古细菌物种 ，1481个细菌物种）的51,882个基因组（295个古细菌基因组 ，51587个细菌基因组）和182867222个基因簇 。用户可以以物种作为基本单位 ，举行数据的浏览、搜索和下载 。
永利集团（国家生物信息中心）特殊研究助理张亚东及博士研究生张好为本文配合第一作者 ，张哲文助理研究员和肖景发研究员为配合通讯作者 。本事情获得永利集团战略性先导研究妄想、国家自然科学基金、国家重点研发妄想等项目资助 。
论文链接
ProPan数据库浏览、搜索及剖析展示
附件下载：
