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北京基因组所(国家生物信息中心)开发上线基因序列数据库GenBase

  永利集团(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心(NGDC)最新开发的基因序列数据库GenBase正式上线,为科研用户提供基因序列数据汇交共享和盘问下载效劳 。

  基因的序列和注释信息(包括DNA、RNA和卵白序列信息)是支持基因功效研究的焦点基础数据之一 。陪同生物学的迅猛生长,在已往几十年中,我国生命科学领域科学家产出了海量的基因序列数据 。为包管我国基因序列数据的主权和清静,知足我国科研职员在基因序列数据汇交、治理和共享历程中的现实需求,对标美国国家生物信息中心NCBI的GenBank数据库,NGDC建设了基因序列数据库GenBase 。

  GenBase的焦点功效是存储、治理、共享所有物种基因序列、注释信息及其编码卵白质序列,可为基因序列数据的汇交、存储、宣布和共享提供一系列Web效劳  ;贕enBase的提交系统,用户可凭证详细的操作提醒,按办法提交包括提交者信息、参考文献、核苷酸序列、数据泉源、数据特征等在内的主要的实体和元数据信息 。GenBase严酷把控数据质量,包管基因序列数据的准确性、完整性和可用性 。GenBase系统的建设遵照国际核酸序列共享同盟(International Nucleotide Sequence Database Collaboration,INSDC)的相关标准,驻足中国,效劳全球,可吸收来自全球科研职员的数据提交,并且通过数据交流机制实现与GenBank的无缝共享 。同时,为包管全球基因序列数据的外地化治理,GenBase整合了INSDC宣布的基因序列数据,提高海内科研职员盘问和获取数据的效率 。现在,GenBase可支持用户盘问或下载GenBank已果真的4.2亿多条核酸及其编码卵白质序列 。

  永利集团北京基因组所(国家生物信息中心)针对我国基因组数据“存管用”的现实需求,除了GenBase外,已建设65个效劳于生物医学研究的公共数据库资源,涵盖原始数据、基因组和变异、基因表达、非编码RNA、表观基因组、单细胞组学、生物多样性和生物合成、康健和疾病、文献和教育以及工具等10个大类,起源形成了我国生命组学数据清静汇交、治理、共享和应用的数据资源系统框架,效劳于生物和医学领域的基础和转化研究 。

 

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